Mehanizam oksidacije skvalena leži u tome što njegovo razdoblje niskog praga ionizacije može donirati ili primati elektrone bez oštećenja molekularne strukture stanica, a skvalen može prekinuti lančanu reakciju hidroperoksida u putu lipidne peroksidacije. Studije su pokazale da je peroksidacija sebuma uglavnom uzrokovana singletnim kisikom, a konstanta ugašenja kisika konstanta kisika u ljudskom sebumu mnogo je veća od ostalih lipida u ljudskoj koži. extinction constant. Međutim, treba napomenuti da iako skvalen može blokirati peroksidaciju lipida, proizvodi skvalena, poput nezasićenih masnih kiselina, također imaju iritantni učinak na kožu.
Squalene peroxide may play a major role in the pathogenesis of acne. U eksperimentalnim modelima na životinjama utvrđeno je da je skvalen monoperoksid visoko komedogen, a sadržaj skvalen peroksida postupno se povećava pod UV zračenjem. Stoga se sugerira da pacijenti s aknama trebaju obratiti pažnju na zaštitu od sunca, a kreme za sunčanje mogu izbjeći peroksidaciju skvalena u fiziološkim koncentracijama uzrokovanim ultraljubičastim zrakama.
